줄거리
서기 2065년 에일리언의 공격으로 지구는 엄청난 혼란을 맞게된다. 에일리언들은 인류의 멸종을 위한 전쟁을 벌여 나가고 이에 살아남은 소수의 인간은 레지스탕스를 만들고 그레이를 캡틴으로 맞서 싸우기 시작한다. 한편 에일리언들을 연구하던 여성과학자 아키는 에일리언들에게서 지구를 구할 수 있는 방법을 알게 되고 영혼을 찾아 모험을 감행한다. 위기에 몰린 아키는 레지스탕스에게 도움을 받고 그레이에게 도움을 요청하여 영혼을 찾아 떠난다. 레지스탕스의 장군은 자신의 가족을 죽인 팬텀을 증오하여 그들을 없애기 위해 많은 준비를 하지만 자신의 뜻과는 다른 길을 가는 아키일행을 잡아 가두게 된다. 결국 레지스탕스기지는 팬텀에게 공격당하고 아키와 그레이 일행은 기지가 공격받는 사이 탈출한다. 아키는 꿈을 통해 팬텀이 다른 별이 폭발할 때 별과 같이 죽어 간 유령이라는 것을 알아낸다. 이후 그들은 팬텀의 본거지로 향하여 모든 것을 원래대로 노력하지만 난관에 부딪히자 그레이는 자신을 희생하여 지구를 구한다.
